电子实验中心采用院、校两级管理运行模式，运行经费及专项建设费用由学校直接投入、教学任务组织和实施由教务处管理，实验中心的日常工作依托电子科学与工程学院进行管理。电子实验中心实行学校领导下的主任负责制，中心主任负责示范中心的全面工作，由电子科学与工程学院院长担任。设立由国家教学名师、校内外知名教授以及企业代表组成的实验教学指导委员会，对中心的实验教学进行指导，设立实验教学顾问组对实验教学进行咨询、督导与质量监控。

电子实验中心专、兼职教师共计76人，其中专职实验教师38人，下设电装实习基地、电路实验室、数字系统实验室、电子技术综合实验室以及创新实验室五个实验室，设立实验教学首席教授，整体负责各实验室建设与改革。